شهر مشهد به خاطر وجود حرم مطهر رضوی دارای موزه های قابل توجهی شده است. مشتاقان و علاقمندان به امام رضا(ع) اشیاء نفیس بسیاری را به حرم آن حضرت اهدا کرده اند که این مجموعه ها به تدریج زمینه ایجاد موزه های گوناگونی همچون موزه قرآن، موزه ظروف، موزه صدف، موزه سلاح و نظایر آن را فراهم کرده است.
علاوه بر آن، مجموعه های تاریخی و فرهنگی شهر مشهد نیز موزه هایی را به خود اختصاص داده است. موزه شهر تاریخی توس اشیاء باستانی قابل توجهی را در خود جای داده است. در مجموعه آرامگاه فردوسی موزه آب حاوی اشیاء جالب توجهی در این زمینه است. موزه تاریخ طبیعی استان خراسان نیز مجموعه بسیار زیبایی را از حیوانات فراهم آورده است.